يتكون هذا الصرح من العناصر الرئيسية التالية: المسجد ومتحف مدينة الطيبات للحضارات العالمية و(بيت عبد الرؤوف خليل التراثي) مؤسس على نمط البيوت الحجازية في حواري جدة القديمة ثم محلات خان آل خليل لبيع الانتيكات والتحف التراثية وبيت ينبع التراثي والمكتبة العامة تحتوي على أكثر من 20000 كتاب ومرجع في مختلف العلوم والمعرفة ومبني المتحف يحتوي على معلومات ما يزيد على 2000م2 معلومات على الجدار مع الصور الإيضاحية والمجسمات ومنها جناح للإعجاز العلمي في القرآن والسنة بمفهوم الآية القرآنية: )مَّا فَرَّطْنَا فِي الكِتَابِ مِن شَيءٍ((الأنعام38) ما يزيد على 500 برنامج للحاسب الآلي في مختلف العلوم والمعارف العديد من الأجنحة المتحفية في مختلف الحضارات الإنسانية جناح من تاريخ كفاح وعبر المغفور له بإذن الله جلالة الملك عبدالعزيز بن عبدالرحمن آل سعود طيب الله ثراه جناح للثقافة الوطنية السعودية جناح للمعادن والأحجار والمجوهرات أجنحة لمدارس الفنون التشكيلية العالمية أجنحة لوحدة الفنون العالمية أجنحة للتراث والفنون الإسلامية أجنحة لتراث وفنون المملكة العربية السعودية أجنحة للعلوم الكونية (المجموعة الشمسية)، وخاصة كوكب الأرض وما عليه من نبات وحيوان وإنسان أجنحة لتاريخ الحضارات القديمة في العالم.
المعروضات بخان آل خليل: (أشرطة وكتب في علوم القرآن الكريم سيوف وبنادق تراثية فخاريات سبح وخواتم سجاد يدوي أعمال فنية فضيات ومجوهرات بدوية ملابس بدوية عملات وطوابع وميداليات مخطوطات وصور قديمة تراثيات أخرى ).
